吕西安所说的新发现，指的是致病菌的发现。
细菌其实很早就被发现了，早在1702年，荷兰科学家列文·胡克就利用他自己发明的显微镜发现了细菌。但是当时的人并没有将细菌和疾病联系起来。而且因为细菌无色透明，即使用显微镜，最多也不过看到一些因为细菌的运动带来的光线折射而形成的影子，根本就看不清细菌的结构特征，自然也无法分辨细菌的种类和数量。
这使得很长一段时间里，细菌的发现除了给人们提供一些谈资之外，基本上就没有其他的意义了。
既然细菌和疾病的关系得不到验证，那么什么消毒杀菌之类的技术自然也不会出现。在此前的战争中，为了降低士兵的损失，约瑟夫借口说在某部中世纪的笔记中看到了，关于东方的野蛮人将包扎用的纱布用沸水煮过之后，能减少伤员发烧化脓的记录。虽然这个说法并没有什么科学依据，但是完全可以用事实来证明一下嘛。
结果事实证明，在使用沸水煮过，然后再在太阳下晒干的纱布代替其他未处理的包扎物，效果非常明显，伤员和俘虏们因为感染而死亡的几率大幅度下降了。
虽然不知道这是什么原因造成的，但是既然这种做法有效，在拿破仑成为了第一执政之后，这类做法就开始在整个的法国推广。包括《柳叶刀》杂志上也提到了这个事情。
约瑟夫表示，“存在即是合理”。既然这个方法被证明有效，那它背后一定有我们还没有来得及发现的科学原因。为此约瑟夫开出了五千法郎的奖金，鼓励学者们研究这后面的科学原理。
不久之前，约瑟夫的一个爱尔兰学生卡罗尔在约瑟夫指点的大方向上，通过自己的努力，获得了决定性的成果。
“老师怀疑，在被煮过的纱布，和没有煮过的纱布上一定有什么我们看不到的差异。他甚至向我提到了列文·胡克先生的发现。
波拿巴老师对我说：‘卡罗尔，我一直有一个怀疑，我怀疑伤口溃疡、发高烧什么的，都是由某种寄生虫造成的。这种寄生虫非常小，很可能比螨虫都小。以至于肉眼无法看到它。列文·胡克先生曾经用显微镜发现过一些非常小的生物，我怀疑，这些东西，可能就是某种非常小的寄生虫，它们也许就是造成伤口溃疡，发烧之类的问题的罪魁祸首。
如果我的这个猜想是真的，那么这种虫子就一定会在化脓溃疡的伤口上大量繁殖。只是这些东西无色透明，我们无法看清楚它们，更不要说确定它们的数量的变化了。唉，要是有办法让它们变成不透明，有颜色的就好了。’
当时我灵机一动，脱口而出：‘我们为什么不试试看能不能用某种染料，给这些小虫子染上颜色呢？’
波拿巴老师对我的这个建议非常的欣赏，他鼓励我就从这个方向去展开研究……此后我试过了很多种染料，但是效果都不好，但是老师一直都在支持我，鼓励我。他对我说：‘我相信，你一定能成为爱尔兰在科学上的骄傲的。’
在老师的鼓励下，我虽然遭遇了一次又一次的失败，但最终，就像老师说的那样，‘机会总是青睐那些有准备的人’……”——《与疾病作斗争——卡罗尔·奥哈夫回忆录》
有了细菌染色技术，细菌和各种感染之间的关系，就变得显而易见了。
在有了这种技术之后的一个多星期里，卡罗尔就画出了包括破伤风杆菌、金黄色葡萄球菌在内的数十种致病菌。依据这个发现，卡罗尔写出了论文，并将它提交给了法兰西科学院。
这绝对是划时代的发现，但是吕西安却提议，将这份论文押后发表。
吕西安说：“约瑟夫，让你的学生将论文改一下，我觉得证据还不够充分，应该还有临床上的数据。我们在法国找一家医院，在这里实验对各种设施，比如床褥呀什么的严格消毒的措施，然后记录病人的感染几率，再选取一家英国医院，最好是有托利党和圣公会背景的医院，弄到他们类似的情况下的感染率和死亡率。
然后我们在《柳叶刀》上先刊登出一篇名为《法国医院的一些经验》的文章。嗯，约瑟夫，我们法国的医院中早就已经开始推行包扎用纱布煮沸日晒消毒了。我们就在这篇文中先介绍这个经验，并特别点明，这一经验来自与东方的游牧民族有关的记录。然后再拿出你的寄生虫猜测，以及我们的医院和英国医院在感染率和死亡率方面的对比。
《柳叶刀》的受众群体非常有限，它的这篇文章不会引起太大的反响。这不要紧，这就是我们所需要的。我们先等一个月，然后让《科学真理报》在科普栏目中加以报道，并指出‘英国人的医院，因为各种肮脏和不卫生的环境，已经成为了对病人进行屠杀的屠场。在《柳叶刀》杂志已经介绍过法国的行之有效的方法之后，整整一个月，英国的医疗部门在这样关系到人民的生命安全的事情上却毫无反应，这值得人们深思。’
这样的报道肯定会激起英国的那些家伙的不满的，接着我们再让《伦敦生意人》发表一篇文章，这篇文章要以经济的角度，来加以分析，并得出与其花费成本来改进医院，还不如就让那些下等人死掉更为合算的结论。
接着再让《太阳报》和《啄木鸟查理》跟上，用最尖刻的语言来挖苦讽刺，最后形成一场大争论。我们让这个争论持续一个月左右，制造各种噱头，让英国人充分表演，然后让《自然》，让我们旗下的其他报刊杂志都卷入进去，然后……”
“《柳叶刀》是双月刊，这个时候正好到了下一期《柳叶刀》出版的时候了。我们就在这一期的《柳叶刀》抛出决定性的证据，也就是约瑟夫你的学生的论文，彻底打垮他们。”拿破仑插嘴说，“我们前面要把浪头弄高一些，最好弄到否定整个英国的医学，最好能勾引着英国王家科学院也跳出来给英国医生行会背书，然后我们一家伙打倒他们，让他们，不论是英国媒体，还是英国科学院都一起名誉扫地。并顺便建立起我们的权威。嗯，我觉得，为了刺激一下英国佬，让他们变得更疯狂，出的洋相更大，我有一个建议……”
说到这里，拿破仑却突然闭了嘴，他回过头来看了看约瑟夫，然后又说：“我就是一个建议，能不能行，咱们再一起讨论……”
“拿破仑，你说什么呢？这里只有咱们兄弟几个，还有什么话是不能说的？赶紧说，别磨叽！”约瑟夫皱着眉头道。
“那我可说了……你别说我不该说，我也就一个提议……要是不行……你就当我没说过……”
“少废话，快说！”
“嗯，我觉得吕西安的这个计划，还有一些细节，可以在完善一下……嗯，我们让波莉娜和大嫂……”说到这里，拿破仑赶紧瞟了约瑟夫一眼，看到约瑟夫的脸上似乎并没有什么生气的神色，便接着说，“让波莉娜陪着大嫂到伦敦去玩，然后作为慈善活动的一部分，去某个英国医院捐款，因为是慈善行动，当然就可以选择比较底层的，条件特别差的医院。
然后《科学真理报》上的那篇引发争议的文章，就可以由波莉娜来写。落款就用她的笔名。英国人肯定不能忍受一个女人对他们指手画脚，肯定会跳得更欢。然后就让波莉娜和他们打笔墨战争……嗯，波莉娜的语言完全可以再锋利一些，挖苦讽刺什么的，怎么尖刻怎么来，怎么不负责任怎么来。其他报纸也可以跟上去讽刺英国人的科学素养还比不上女人……这真是，我想想都觉得好玩，甚至于比莫里哀的那些喜剧都要更好玩了……嗯……约瑟夫，你要是觉得不行，我们再另想个办法？”
“为什么不行？”约瑟夫道，“我觉得这办法不错呀。不过，你把范妮扯进去干什么？让她去了，你来给我当秘书？再说了，范妮根本就不是干这种闯祸的事情的料，让波莉娜自己去不就行了吗？反正她本来也就是个闯祸精！正好让她本色出演。当然，这事情呢，一定要得到波莉娜自己的同意。她必须是自愿的……嗯，你们谁去和她说这个事？”
拿破仑立刻就把眼光转向了吕西安。
“看我干什么？”吕西安说。他当然知道，要让那个女闯祸精同意去干这个事，一点难度都没有。但是如果是自己去说的。将来，万一那个女闯祸精弄过头了，出了什么问题，弄得妈妈问了起来，就这两个哥哥一贯偏心眼的表现来看，多半，不，不是多半，而是绝对会把所有的锅都丢到自己头上。
“毕竟你经常带着波莉娜到处玩的。就连妈妈都知道你和波莉娜很好的。”拿破仑暗带威胁地说。
“好吧，好吧。”吕西安举手投降，“不过，到时候妈妈知道了，你们可别……”
“如果妈妈知道了，那一定是因为你太无能了，吕西安。”拿破仑说。