女娲舰的炮手在接到命令之后立刻开炮，炮弹随即飞向了距离女娲舰最近的皮萨罗舰，第一枚炮弹落在皮萨罗舰前方的水面上，砸起一团水柱。
上官云龙随即命令女娲舰调整航向，把侧舷的火炮也对准敌舰，女娲舰很快完成舰身转向，向皮萨罗舰发射了炮弹。
与此同时，林飞也命令天龙舰和云龙舰向科尔特斯舰开炮，不过天龙舰和云龙舰距离科尔特斯舰比较远，炮弹都落在了科尔特斯舰的后面，相对之下，反倒是女娲舰取得了不错的战果，6点46分，一枚穿甲弹从水下击中皮萨罗舰的舰首，大量海水涌入舰身。
在和乐岛战役中，西班牙军舰由于舰身密封部件老化，所以在中弹之后很快沉没，他们在返回港口之后，更换了军舰上的密封部件，这些密封部件救了皮萨罗舰的命，皮萨罗舰的舰长发现舰首进水就立刻下令关闭舰首中弹部位的水密舱，舰身进水这才没有影响到全舰。
皮萨罗舰也开始还击，不过西班牙水兵没有太多的战意，一心想着逃跑，所以女娲舰并没有受到损伤。
6点52分，天龙舰抵近到科尔特斯舰2500米距离，林飞果断下令，舰首主炮，使用全速射！
孙勇随即操作火神炮，用最高速度打出炮弹，由于距离敌舰2500米，所以十五枚炮弹只有两枚命中了科尔特斯舰，其中一枚直接击中舰桥指挥室，查理一世舰的舰长诺曼斯顿被当场击毙，班德拉斯司令受了轻伤。
另一枚炮弹命中了侧舷的炮位，引爆了堆积在火炮附近的炮弹，在和乐岛战役中，女娲舰发射的一枚炮弹直接命中了西班牙舰队旗舰舰尾的火炮，引爆了堆积的炮弹，结果造成大爆炸，几乎把整个舰尾炸飞。
这次班德拉斯司令有了和乐岛战役的教训，没有命令部下在炮位上堆积太多的炮弹，如果按照和乐岛战役时的堆法，整个科尔特斯舰的侧舷都会被炸开，这次殉爆虽然让战舰沉没，可是也对战舰造成了重创。
天龙舰舰长刘大明见到两枚炮弹击中敌舰，兴奋地说道：“加快速度，冲上去，把敌舰击沉！”天龙舰舰员们群情激昂，纷纷欢呼了起来，打算一鼓作气冲过去，击沉科尔特斯舰。
“等等！”林飞的声音突然在后面响起，刘大明一回头，惊声问道：“怎么了？”
林飞平静地说道：“我们不能追！”
刘大明一头雾水，茫然说道：“为什么不能追？敌舰已经没有战意了！”
林飞用手指了指远处的科雷希多岛，说道：“我们还没有把东部的炮台打下来，如果我们追击敌舰，很有可能被岸防重炮伤到，所以我们不能追赶。”
刘大明想了想说道：“岛上的炮台守军连自己都顾不上了，能开炮打我们吗？”
林飞眉头一皱，说道：“我不允许冒险，听我的命令，停止追赶，立刻撤退！”林飞一边说着一边给上官云龙发出了命令，上官云龙虽然心有不甘，可是不敢违背林飞的命令，跟着林飞撤回岛屿西部。
科尔特斯舰和皮萨罗舰与天龙舰、云龙舰和女娲舰交战和撤退的情景都被岛上的观察员看在眼中，观察员急忙向守备司令麦斯威尔报告：“我们的战舰撤走了！”
麦斯威尔急忙追问：“我们的战舰为什么会撤走？为什么不继续攻击？”
观察员说道：“我们看到了他们和华夏帝国军舰交战的情景，他们受了伤，就撤退了。”
麦斯威尔放下电话，长叹一声，这时参谋过来说道：“报告麦斯威尔司令，岛西侧的炮台已经全部被华夏帝国占领，据海岸防卫队的侦察兵讲，华夏帝国又有大批部队登岛。”
麦斯威尔急忙问道：“他们有多少人登岛？”
参谋摇头说道：“不清楚。”
麦斯威尔思索片刻，直接把电话打给了桑德斯总督，说道：“总督大人，我们的战舰被敌军击败，岛屿西侧的炮台此时已经全部被敌军占领，大批敌军正在登岛，我军请求撤退。”
桑德斯总督沉默一阵，说道：“我们的援兵还有两个小时就能赶到了，你们能再坚持两个小时吗？”
麦斯威尔说道：“不可能的，我们连一个小时都坚持不住了。”
桑德斯总督长叹一声，说道：“那你们就撤回来吧。”
麦斯威尔于是下达了撤退的命令，科雷希多岛的防御态势是西侧兵力多，东侧兵力少，再加上麦斯威尔先前把东侧的守军大部分调集到了西侧，所以东侧没有多少守军，很快守军就撤退了。
守军在撤退之前炸毁了自己控制下的所有炮台，他们在弹药库里装上了延时起爆装置，在离开之后引爆了弹药库。
炮台的弹药库位于地下，由一套提升装置把炮弹运到炮位上，在地下的爆炸发出的声音不大，因为爆炸的时候不接触空气，不过这种爆炸可以产生很强的震动，大地都跟着摇晃，好像地震似的。
林飞的部下听到地下传出来的一声声闷响，感到脚下一阵阵晃动，便猜到西班牙人正在炸毁炮台，准备撤退，他们也没有过去追赶，因为他们担心西班牙人留下了伏兵。
****上午10点50分，科雷希多岛东侧安静下来，林飞部队第五团进入岛屿东部，占领了东部码头，至此，科雷希多岛战役全部结束。
这场战役分为三个阶段，第一阶段，蛙人突击队上岛偷袭探照灯阵地，由于西班牙军队突然增强了防御，所以没能达到既定战役目标；第二阶段，第四团在敌军炮火下冒死抢滩，在付出不小代价后终于登上岛屿。
第三阶段，第四团夺下滩头，向岛屿纵深扩展，第五团随后登陆，进攻全岛，在经过激烈的战斗后，第四团和第五团夺取了整座岛屿。
在三个阶段的作战中，华夏帝国阵亡258人、受伤369人、失踪35人，毙伤敌1514人，俘敌468人，缴获敌350毫米岸防重炮二十六门，炮弹四百多发，另有步枪多支，子弹多发。
这场战役还有海上作战阶段，海上作战分为两部分，第一部分，天龙舰、云龙舰在科雷希多岛海域与查理一世舰交战，交战的结果是，天龙舰和云龙舰将查理一世舰击沉；第二部分，天龙舰、云龙舰和女娲舰与西班牙科尔特斯舰和皮萨罗舰交战，交战的结果是，科尔特斯舰和皮萨罗舰遭到重创，撤回马尼拉。
这场战役史称“科雷希多岛战役”，华夏帝国获得了战役的胜利，这场战役的胜利，让林飞打开了马尼拉湾的西大门，从此可以畅通无阻地进出马尼拉湾。
这场战役结束后，林飞命令参战部队在科雷希多岛上休整两天，于6月6日继续向马尼拉进军。
在休整的两天中，林飞进行了一系列战役总结工作，林飞首先听取了孙勇的报告，孙勇对林飞说道：“陛下，在科雷希多岛海战中，我舰发射的炮弹和云龙舰发射的炮弹时间上间隔太小，导致炸点没法观测。”
林飞点点头，心想这个问题一定要解决好，如果不解决好，以后面对强敌的时候必然会导致失败，于是林飞让孙勇回去，自己开始思索解决的办法，他突然想到，在我的时代，英国海军曾经用过在炮弹中加装彩色发烟药剂的方法，我也可以尝试一下。
林飞于是制定了彩色发烟药剂的生产计划，不过这个计划中缺少各种化学药剂，只能暂时放下。
在频繁的交战中，火神炮还暴露出了一些问题，比如高射速条件下制退液过热，影响制退效能，火炮身管发生膨胀导致射击出现较大误差等等，林飞知道要解决这些困难必须改进炮身材料，可是现在他还没有条件生产性能更加优良的钢。
无法生产性能更加优良的钢有三方面的因素，第一是缺乏某些微量元素的矿石，无法对钢材进行调质；第二是炼钢设备的落后，华夏帝国此时只有炼钢转炉，没有冶炼高性能钢材的电炉；第三是人的因素，华夏帝国缺乏精通钢铁冶金的人才，林飞一个人毕竟孤掌难鸣。
林飞此时还无法解决这些问题，所以无法改进火神炮，只能从火炮的使用上想办法，那就是限制火神炮的射速，规定最高实战射速为十二枚每分钟。
改进了海军方面，林飞又开始对陆军进行改革，在第四团的登岛作战中，由于运输船间隔分散，导致上岸之后建制被打乱，各个部队混合在了一起，在这种情况下出现了指挥权不明的现象，比较典型的一例就是石强和孟栋国不知道谁该当主官，这次虽然没有造成不良后果，可在以后面对强敌时却后患无穷。
于是林飞决定，在军队全面推行军衔制，此前由于军队规模比较小，所以林飞没有推行军衔制，推行军衔制有一个好处，那就是在建制被打乱的情况下可以按照军衔的高低明确指挥权。